تأثیر دما بر ساختار فاکتور رشد شبه انسولینی (igf-1) و مطالعه ای مبتنی بر شبیه سازی با روش های دینامیک مولکولی و محاسبات کامپیوتری

زمینه و هدف: فاکتور رشد شبه انسولینی به طور طبیعی در سیستم عصبی مرکزی (cns) موجود است و نقش مهمی در تکثیر و تمایز سلولی در طی رشد و بلوغ مغز دارد. این فاکتورها به همراه پروتئین های پیوند به آن ها و گیرنده هایشان در نواحی آسیب دیده ی مغز بیان می شوند که نقش سیستم igf ها را در آسیب مغزی نشان می دهد. شبیه سازی مولکولی یک روش محاسباتی مستقیم برای مطالعه ی تغییرات ساختمانی طیف وسیعی از مسایل فیزیکی و بیولوژیکی می باشد. از نظر محاسباتی، میدان های نیروی تجربی اشکال زیادی در شبیه سازی تا خوردن فاکتور رشد شبه انسولینی دارند. مواد و روش ها: در این مطالعه درجه حرارت انتقال برای igf-1 مدل شد. سیستم به تعادل رسید و در مدت 100 پیکوثانیه برای تحلیل با روش مولکولار دینامیک مطالعه شد. یافته ها: بررسی تغییرات انرژی پتانسیل در سه میدان نیرو مشخص نمود، میدان نیروی amber از میدان نیروی mm+ و opls بهتر می باشد و نیز شبیه سازی md حداقل در این مدل از روش های mc و ld اثرپذیری بیشتری دارد. نتیجه گیری: درجه حرارت های پایین باعث پایداری ساختار می شود، در صورتی که درجه حرارت های بالا حالت عکس دارد.